Chương trình giáo dục bậc THCS tại Trường Văn Hóa Việt được thiết kế dành riêng cho học sinh từ lớp 6 đến lớp 9. Chương trình áp dụng phương pháp giáo dục phù hợp với từng đối tượng học sinh, giúp các em nắm bắt đầy đủ kiến thức một cách chọn lọc và có khả năng tự học. Đặc biệt, trường chú trọng trau dồi cho học sinh khả năng học ngoại ngữ và phát triển các kĩ năng sống cần thiết.
Mỗi lớp sĩ số tối đa 35 học sinh, được giảng dạy theo chương trình của Bộ Giáo dục và Đào tạo kết hợp với chương trình nâng cao các môn Toán, Ngữ văn, Ngoại ngữ, Tin học và các kỹ năng mềm.
Bên cạnh đó, tổ chức sinh hoạt các CLB và các chương trình ngoại khóa giúp các em có thể học tập thông qua các hoạt động thực tế.